Sau khi nắm thông tin Thanh Hóa không tham dự giải, VFF đã đề xuất lên AFC về việc cử CLB khác thay thế nhưng không được đồng ý, có thể do thời gian quá cận với những nhà tổ chức. Vì thế, tham dự đấu trường AFC Champions League Two mùa bóng 2024-2025 (Cúp C2), Việt Nam chỉ còn 1 CLB là Nam Định.
Đáng chú là là do thành tích của các đại diện Việt Nam tham dự giải châu Á gần đây không tốt, điều đó đã làm cho Việt Nam không còn suất tham dự ở AFC Champions League (hay còn gọi là Cúp C1). Bên cạnh đó vẫn giữ được 2 suất tham dự Cúp C2. Thực lực của Nam Định và Thanh Hóa được nhận định là đủ sức tiến xa ở đấu trường này.
Nhưng đáng tiếc là Thanh Hóa đã xin rút lui vì lịch thi đấu của đội ở mùa bóng 2024-2025 là rất dày khi đối diện với khả năng tham dự 4 giải đấu gồm V-League, Cúp Quốc gia, Cúp C2 châu Á và giải vô địch các CLB Đông Nam Á. Vì thế, để bảo đảm lực lượng tốt nhất, lãnh đạo đội bóng xứ Thanh đã buộc phải rút lui ở 1 trong 2 giải đấu quốc tế.
Lễ bốc thăm chia bảng Cup C2 châu Á sẽ diễn ra vào giữa tháng 8. Các đội sẽ bắt đầu tranh tài một tháng sau đó. Đến nay, hai CLB Việt Nam đạt thành tích tốt nhất khi tham dự giải đấu này là Becamex Bình Dương và Hà Nội FC. Trong đó, đội bóng đất Thủ đã lọt vào đến trận bán kết.
