Trở lại sau 5 năm vắng bóng, giải bóng đá U16 nữ Đông Nam Á 2025 vẫn duy trì được 9 đội tham dự (giải đã tổ chức các năm 2017, 2018, 2019). Một điểm khác so với 3 mùa giải trước, đó là 9 đội bóng được chia vào 3 bảng thay vì 2 bảng, thi đấu vòng tròn 1 lượt tính điểm xếp hạng; 3 đội đứng đầu và đội đứng thứ 2 có thành tích tốt nhất sẽ vào chơi bán kết. Các trận đấu giải bóng đá U16 nữ Đông Nam Á 2025 sẽ diễn ra từ ngày 18-8 đến 30-8 tại Indonesia.
Căn cứ kết quả mùa giải gần nhất U16 nữ Đông Nam Á (2019), đội tuyển U16 nữ Việt Nam được xếp nhóm hạt giống số 1 cùng với chủ nhà Indonesia và Thái Lan. Nhóm hạt giống thứ 2 gồm Malaysia, Myanmar và Singapore trong khi nhóm hạt giống còn lại gồm Campuchia và 2 đội lần đầu tham dự giải Timor Leste và Australia thay cho sự vắng mặt của hai đại diện Lào và Philippines.
Kết quả bốc thăm, bảng A gồm chủ nhà Indonesia, Malaysia, Timor Leste thì bảng C được đánh giá hấp dẫn với các đối thủ Thái Lan, Singapore và Australia.
Chuẩn bị cho giải đấu này, đội tuyển U16 nữ Việt Nam sẽ chính thức tập trung từ ngày 23-7 tại Trung tâm đào tạo bóng đá trẻ Việt Nam, dưới sự dẫn dắt của huấn luyện viên trưởng người Nhật Bản Okiyama Masahiko. Danh sách 30 vận động viên đã được triệu tập từ 4 địa phương Hà Nội, TPHCM, Hà Nam, Thái Nguyên và 2 vận động viên thuộc quân số đội dự tuyển nữ trẻ của LĐBĐ Việt Nam.
