Hội đồng kỷ luật của Liên đoàn bóng đá Thổ Nhĩ Kỳ mô tả những bình luận của Mourinho là phi thể thao, và phạt ông 26.200 USD vì đặt câu hỏi về sự công bằng của trọng tài và các quan chức trận đấu khác. Hội đồng đã cấm cựu HLV Chelsea chỉ đạo 1 trận và phạt ông 1.700 USD vì hành vi phi thể thao đối với người hâm mộ đối phương. Lệnh cấm này cũng ngăn cản Mourinho vào phòng thay đồ của đội. Ông sẽ phải chấp hành lệnh cấm vào Chủ Nhật khi Fenerbahce tiếp đón Sivasspor.
Mourinho, người đang trong mùa giải đầu tiên tại Fenerbahce, đã nói rằng giải đấu Thổ Nhĩ Kỳ “có mùi khó chịu” và đặt câu hỏi tại sao những người nước ngoại lại theo dõi giải đấu này. Ông thậm chí còn tuyên bố sẽ không bao giờ nhận lời dẫn dắt Fenerbahce nếu các quan chức CLB nói với ông “toàn bộ sự thật” về cách thức hoạt động của giải đấu. Lời chỉ trích này xuất hiện vào Chủ Nhật mặc dù đội của ông đã đánh bại Trabzonspor với tỷ số 3-2, sau khi ghi bàn thắng quyết định ở phút bù giờ thứ 12 - dẫn đến màn ăn mừng cuồng nhiệt khi vị HLV người Bồ Đào Nha chạy vào sân và cố gắng trượt đầu gối khiến ông… ngã sấp mặt xuống cỏ.
Vào thứ Năm vừa qua, Mourinho đã phải theo dõi từ khán đài khi Fenerbahce thua 1-3 trước AZ Alkmaar ở Europa League. Ông đang chịu án treo giò một trận sau chiếc thẻ đỏ ở trận hòa đội bóng cũ Man.United trước đó. Liên quan đến án phạt này, nhà cầm quân 61 tuổi cũng buông lời mỉa mai rằng ông nên huấn luyện một đội không tham gia các giải đấu của UEFA.
Mourinho gia nhập Fenerbahce vào tháng 6 với nhiệm vụ đưa CLB trở lại đỉnh cao, sau khi không giành được chức vô địch Thổ Nhĩ Kỳ kể từ năm 2014. Sau 10 trận mùa giải này, Fenerbahce hiện kém 5 điểm so với đội dẫn đầu và là kình địch Galatasaray.